Снова одолев Боузера и защитив Бруклин, Марио думал, что настало время передышки. Однако покой оказался недолгим. Коварный союз между бандой Варио и Боузером-младшим грозит новой бедой. Их амбиции не знают границ — они задумали подчинить себе весь мир. Теперь Марио не может оставаться в стороне. Вместе с верными союзниками и неунывающим Йоши ему предстоит вступить в схватку. Их цель — сорвать опасные замыслы и не дать захватчикам осуществить свои глобальные планы.